Κι ενώ η ενημέρωση που είχαν οι ομάδες Γ’ Εθνικής ήταν ότι το Κύπελλο Ελλάδας θα ξεκινήσει στις 31 του μήνα, κι ότι όπως τα δυο τελευταία χρόνια στην Α’ φάση θα αγωνίζονταν μόνο ομάδες αυτής της κατηγορίας, τελικά η ΕΠΟ ξαφνικά αποφάσισε (λόγω καθυστερημένης έναρξης) ότι αυτό θα ξεκινήσει στις 23 (ως 25 οι αγώνες) του μήνα, αμέσως μετά την πρώτη αγωνιστική του πρωταθλήματος δηλαδή, κι ότι από την Α’ φάση θα μπουν και οι ομάδες της Β’ Εθνικής. Την προσεχή Τετάρτη 10/10 η κλήρωση.
Ο Πανηλειακός αν προκριθεί, θα δώσει και δεύτερο αγώνα μετά από μια εβδομάδα!
Από την 1η φάση έως και την 4η φάση θα διεξαχθεί μία ενιαία κλήρωση (θα βγουν δηλαδή από την αρχή τα ζευγάρια για αυτές τις φάσεις, με νικητές αγώνων, κ.τ.λ.). Για την 5η και την 6η φάση θα διεξαχθεί μία κλήρωση. Οι αγώνες Κυπέλλου Ελλάδας ολοκληρώνονται σε επτά (7) φάσεις:
1η ΦΑΣΗ (23, 24 και 25 Οκτωβρίου 2012)
Θα λάβουν μέρος οι είκοσι πέντε (25) ομάδες της Γ΄ Εθνικής Κατηγορίας και οι είκοσι μία (21) ομάδες της Β΄ Εθνικής Κατηγορίας. ΣΥΝΟΛΟ: 46 ΟΜΑΔΕΣ. Θα διεξαχθούν σύνολο είκοσι τρεις (23) απλοί αγώνες.
Η κλήρωση των αγώνων της 1ης φάσης θα διεξαχθεί με δύο κληρωτίδες. Στην μία θα τοποθετηθούν οι ομάδες της Γ΄ Εθνικής Κατηγορίας και στην άλλη οι ομάδες της Β΄ Εθνικής Κατηγορίας. Οι πρώτοι 21 αγώνες θα διεξαχθούν μεταξύ των ομάδων Γ΄ και Β΄ Εθνικής στην έδρα των ομάδων της Γ΄ Εθνικής Κατηγορίας. Οι υπόλοιποι 2 αγώνες με τις τελευταίες 4 ομάδες της Γ΄ Εθνικής Κατηγορίας στην έδρα της ομάδας που κληρώνεται πρώτη.
ΣΥΝΟΛΟ: 23 ΟΜΑΔΕΣ θα προκριθούν στη 2η Φάση .
2η ΦΑΣΗ (30, 31 Οκτωβρίου και 1 Νοεμβρίου 2012)
Θα λάβουν μέρος οι 23 νικήτριες ομάδες που θα προκύψουν από την 1η φάση.
Οι πρώτες 14 ομάδες που θα κληρωθούν θα αγωνιστούν μεταξύ τους σε 7 απλούς αγώνες στην έδρα της ομάδας που κληρώνεται πρώτη. Θα προκριθούν οι επτά (7) νικήτριες ομάδες.
Οι υπόλοιπες εννέα (9) ομάδες προκρίνονται στην επόμενη φάση χωρίς αγώνα
ΣΥΝΟΛΟ: 16 ΟΜΑΔΕΣ θα προκριθούν στην 3η Φάση .
Στους αγώνες της 1ης και 2ης φάσης σε περίπτωση ισόπαλου αποτελέσματος στην Κανονική διάρκεια των αγώνων ο νικητής θα αναδεικνύεται με την διαδικασία ημίωρης παράτασης και εκτέλεσης επανορθωτικών λακτισμάτων (πέναλτι) κατά την διαδικασία που προβλέπει το άρθρο 20 παρ. 9 του ΚΑΠ Επαγγελματικών Πρωταθλημάτων.
3η ΦΑΣΗ (28, 29 Νοεμβρίου και 12, 13 Δεκεμβρίου 2012 – επαναληπτικοί αγώνες: 19, 20, 22 και 23 Δεκεμβρίου 2012)
Θα λάβουν μέρος οι δέκα εξι (16) ομάδες που θα προκριθούν από τους αγώνες της 2ης Φάσης και οι δέκα εξ (16) ομάδες της Super League.
Σε κάθε αγώνα θα συμμετέχει μία ομάδα Β΄ ή Γ΄ Εθνικής και μία ομάδα Super League.
Η κλήρωση των αγώνων της 3ης φάσης θα διεξαχθεί με τρεις (3) κληρωτίδες. Στην μία θα τοποθετηθούν οι νικήτριες ομάδες της 2ης φάσης Στη δεύτερη κληρωτίδα οι ομάδες της Super League. Στην τρίτη κληρωτίδα θα τοποθετηθούν 32 κλήροι : 16 με την ένδειξη ΟΜΑΔΑ Β΄ ή Γ΄ Εθνικής και 16 με την ένδειξη ΟΜΑΔΑ Super League. Πριν την κλήρωση για κάθε ζευγάρι της 3ης φάσης ο κλήρος της 3ης κληρωτίδας θα καθορίζει την γηπεδούχο ομάδα της 1ης αγωνιστικής.
Θα διεξαχθούν δεκαέξι (16) διπλοί αγώνες (εντός και εκτός έδρας).













